Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme3Q9WV85 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms