Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec2Q9WV35 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apobec2Q9WV35 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec2Q9WV35 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec2Q9WV35 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec2Q9WV35 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms