Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnfsf13bQ9WU72 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms