Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpc2Q9R244 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc2Q9R244 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc2Q9R244 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms