Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cbx8Q9QXV1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cbx8Q9QXV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms