Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trp53inp1Q9QXE4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms