Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim44Q9QXA7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim44Q9QXA7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim44Q9QXA7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms