Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt17Q9QWL7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms