Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psma6Q9QUM9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psma6Q9QUM9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms