Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tlr5Q9JLF7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr5Q9JLF7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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