Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmx1aQ9JKU8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmx1aQ9JKU8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms