Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms