Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx5Q9JKQ4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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Irx5Q9JKQ4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Irx5Q9JKQ4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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