Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl39Q9JKF7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms