Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd3Q9JJY3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms