Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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