Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1fQ9JIS7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms