Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sv2aQ9JIS5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sv2aQ9JIS5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sv2aQ9JIS5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sv2aQ9JIS5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sv2aQ9JIS5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms