Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pus3Q9JI38 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms