Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ush1cQ9ES64 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ush1cQ9ES64 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms