Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc28a3Q9ERH8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc28a3Q9ERH8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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