Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr61Q9ERF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr61Q9ERF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr61Q9ERF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Wdr61Q9ERF3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr61Q9ERF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms