Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Cpsf1Q9EPU4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpsf1Q9EPU4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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