Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ap3s1Q9DCR2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms