Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufa8Q9DCJ5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufa8Q9DCJ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms