Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GabarapQ9DCD6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabarapQ9DCD6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms