Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrpraQ9DBG7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms