Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Asf1bQ9DAP7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Asf1bQ9DAP7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms