Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift43Q9DA69 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms