Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cnot8Q9D8X5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cnot8Q9D8X5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms