Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Derl3Q9D8K3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Derl3Q9D8K3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms