Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d4aQ9D7V1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d4aQ9D7V1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms