Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp5Q9D7S9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp5Q9D7S9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms