Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn23Q9D7D7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn23Q9D7D7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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