Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb4aQ9D6F9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms