Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc39Q9D5Y1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms