Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms