Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc83Q9D4V3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc83Q9D4V3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms