Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4933428M09RikQ9D3X3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms