Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vsig1Q9D2J4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vsig1Q9D2J4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms