Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms