Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Susd3Q9D176 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms