Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hddc3Q9D114 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Hddc3Q9D114 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hddc3Q9D114 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms