Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snu13Q9D0T1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms