Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3bQ9CZT8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms