Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cmss1Q9CZT6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmss1Q9CZT6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms