Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS3

Fopnl, LisH domain-containing protein FOPNL, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FopnlQ9CZS3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FopnlQ9CZS3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FopnlQ9CZS3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms