Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shisa9Q9CZN4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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