Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nde1Q9CZA6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms