Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms